1. Продукти
  2.   Диаграма
  3.   Python
  4.   pyCirclize
 
  

Безплатна Python библиотека за кръгови визуализации

Отворена Python библиотека за диаграми за кръгова визуализация. Библиотеката позволява създаване на диаграми на акорди, кръгови теплови карти, кръгови бар графики, радиална диаграма и много други.

В постоянно развиващия се свят на визуализацията на данни разработчиците непрекъснато търсят инструменти, които съчетават гъвкавост, лесна употреба и мощни функции. Библиотеката pyCirclize е такъв отворен Python инструмент, който позволява на разработчиците да създават зашеметяващи кръгови визуализации с минимални усилия. Библиотеката е проектирана за програмен създаване и управление на кръгови визуализации. Вдъхновена от R пакета circlize, тя позволява на разработчиците да изработват зашеметяващи кръгови графики за геномни, биологични и визуализационни приложения. Библиотеката предлага интуитивен API за рендериране на тракове, топлинни карти, връзки и други, което я прави ценен инструмент за софтуерни разработчици, желаещи да интегрират кръгови диаграми в своите приложения.

Библиотеката pyCirclize е изградена върху Matplotlib, което я прави силно персонализируема и съвместима с други Python инструменти за визуализация. Ето някои от отличителните функции, които правят pyCirclize мощен инструмент за разработчиците, Тя визуализира взаимоотношения между обекти с персонализируеми връзки и цветове, представя матрици или йерархични данни в радиален изглед, показва категориални данни в кръгов формат с анотации, създава карти на хромозоми, генни тракове и синтени графики, изградена върху Matplotlib, позволявайки на разработчиците да персонализират всеки аспект на визуализацията, безпроблемно да се интегрират с други Python библиотеки и рамки и т.н. Софтуерните разработчици могат да комбинират pyCirclize с интерактивни рамки като Dash или Streamlit, за да създадат уеб базирани приложения, както и да оптимизират производителността, като обработват големи набори от данни ефективно преди визуализацията.

Previous Next

Започване с pyCirclize

Препоръчителният начин за инсталиране на библиотеката pyCirclize е чрез PyPI. Моля, използвайте следната команда за гладка инсталация.

Инсталиране на библиотеката pyCirclize чрез pypi

pip install pycirclize

Инсталиране на библиотеката Py2pUML чрез conda-forge

Install conda-forge package

Създаване на хордови диаграми с Python

Хордовите диаграми са идеални за визуализиране на взаимоотношенията между обекти. Отворената библиотека pyCirclize позволява на софтуерните разработчици да създават хордови диаграми с персонализируеми цветове, етикети и стилове на връзките в Python приложения. Следният пример демонстрира как да създадете хорда диаграма, показваща взаимоотношенията между обекти A, B, C и D, използвайки Python команди.

Как да създадете хорда диаграма в Python приложения?

from pycirclize import Circos
import matplotlib.pyplot as plt

# Define relationships
relationships = [
    ("A", "B", 5),
    ("A", "C", 3),
    ("B", "C", 2),
    ("C", "D", 7),
    ("D", "A", 4),
]

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=["A", "B", "C", "D"])

# Add chords
for source, target, value in relationships:
    circos.link((source, 0, 1), (target, 0, 1), color="skyblue", direction=1, ec="black", lw=1)

# Plot
circos.plot()
plt.show()

Поддръжка на кръгови топлинни карти

Кръговите топлинни карти са отличен начин за представяне на данни в радиален изглед. Софтуерните разработчици могат да ги използват за визуализиране на матрици или йерархични данни в собствените си приложения. Следният пример с код генерира кръгова топлинна карта, използвайки случайни данни. Можете да разширите това, за да създадете приложение, което позволява на потребителите да качват свои набори от данни и да персонализират топлинната карта.

Как да създадете кръгов топлинен график с помощта на Python библиотека?

import numpy as np
from pycirclize import Circos

# Generate random data
np.random.seed(42)
data = np.random.rand(10, 10)

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=np.arange(10))

# Add heatmap
circos.heatmap(data, cmap="viridis")

# Plot
circos.plot()
plt.show()

Създаване на кръгови бар графики

Кръговите стълбови графики са перфектни за визуализиране на категориални данни в кръгов формат. Те са силно персонализируеми и могат да включват анотации. Отворената библиотека pyCirclize улеснява софтуерните разработчици да създават и управляват кръгови стълбови графики в Python приложения. Следният пример с код създава кръгова стълбова графика, показваща стойностите за различни категории. Можете да интегрирате това в приложение за изследване на данни и отчитане.

Как да създадете кръгов бар график с помощта на Python библиотека?

import numpy as np
from pycirclize import Circos

# Generate random data
np.random.seed(42)
data = np.random.rand(10, 10)

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=np.arange(10))

# Add heatmap
circos.heatmap(data, cmap="viridis")

# Plot
circos.plot()
plt.show()

Визуализация на геномни данни

Отвореният код на библиотеката pyCirclize е особено полезен за визуализиране на геномни данни в Python приложения. Тя предоставя специализирани инструменти за визуализиране на геномни данни, като карти на хромозомите, генни тракове и синени графики. Ето полезен пример с код, който позволява на разработчиците да създадат кръгов график, представящ хромозомите с техните съответни размери.

Как да създадете кръгов график, представящ хромозоми, използвайки Python?

from pycirclize import Circos

# Define chromosome sizes
genome = {
    "Chr1": 200,
    "Chr2": 150,
    "Chr3": 100,
}

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=genome)

# Add chromosome tracks
for sector in circos.sectors:
    sector.text(f"{sector.name}", size=15)
    sector.xticks_by_interval(50, label_size=10)

# Plot
circos.plot()
plt.show()
 Български