Open Source Java-bibliotek for bildebehandling

Komme i gang med ImgLib2

Den enkleste og anbefalte måten å installere ImgLib2 på er via GitHub.

go get -u github.com/imglib/imglib2.git 

Opprette nye bilder via Java

Open source Java-biblioteket ImgLib2 har inkludert støtte for å lage et nytt bilde fra bunnen av med bare et par linjer med Java-kode. Ved å bruke ImgLib2-biblioteket kan du lage forskjellige typer bilder som enkle bilder, 3D-bilder, ImgFactory og mer. Du kan også endre bilder av de eksisterende bildene med bare et par linjer med kode.

        public Example1c()
        {
            // create the ImgFactory based on cells (cellsize = 5x5x5...x5) that will
            // instantiate the Img
            final ImgFactory< FloatType > imgFactory = new CellImgFactory<>( new FloatType(), 5 );
            // create an 3d-Img with dimensions 20x30x40 (here cellsize is 5x5x5)Ø
            final Img< FloatType > img1 = imgFactory.create( 20, 30, 40 );
            // create another image with the same size. Note that the input provides the size for the new image as it implements the Interval interface
            final Img< FloatType > img2 = imgFactory.create( img1 );
            // display both (but they are empty)
            ImageJFunctions.show( img1 );
            ImageJFunctions.show( img2 );
        }

Bildeduplikering via Java API

ImgLib2-biblioteket har inkludert funksjonalitet for bildeduplisering ved bruk av Java-kommandoer. Du kan enkelt lage en kopi av det eksisterende bildet. Du kan bruke Cursorer for å oppnå denne oppgaven. Du kan også bruke kopieringsmetoden som er en generisk metode, og det fine er at den vil fungere på alle typer type.

	public DuplicateImage() throws ImgIOException
	{
		// open with SCIFIO as a FloatType
		Img< FloatType > img = IO.openImgs( "DrosophilaWing.tif", new FloatType() ).get( 0 );
		// copy the image, as it is a generic method it also works with FloatType
		Img< FloatType > duplicate = copyImage( img );
		// display the copy
		ImageJFunctions.show( duplicate );
	}
        // Generic, type-agnostic method to create an identical copy of an Img
	public < T extends Type< T > > Img< T > copyImage( final Img< T > input )
	{
		// create a new Image with the same properties
		Img< T > output = input.factory().create( input );
		// create a cursor for both images
		Cursor< T > cursorInput = input.cursor();
		Cursor< T > cursorOutput = output.cursor();
		// iterate over the input
		while ( cursorInput.hasNext())
		{
			// move both cursors forward by one pixel
			cursorInput.fwd();
			cursorOutput.fwd();
			// set the value of this pixel of the output image to the same as the input,
			// every Type supports T.set( T type )
			cursorOutput.get().set( cursorInput.get() );
		}
		// return the copy
		return output;
	}

Vis bilder Delvis via Java

Det gratis ImgLib2-biblioteket gjør det mulig for programvareutviklere å vise bare noen deler av bildet i appene sine via et par linjer med Java-kode. Visninger er veldig kraftige, og du kan bruke dem til å vise utvalgte deler av bildene, vise en rotert visning og få andre ting. Visninger kan være RandomAccessible, Interval, og kan derfor gjøres Iterable.

Sparsom databehandling

Det gratis ImgLib2-biblioteket gir programvareutviklere muligheten til å jobbe med sparsomme data ved hjelp av Java-kode. Biblioteket har levert to interpolasjonsskjemaer for visning av sparsomme data. Brukere kan beregne en verdi for hver plassering i verdensrommet ved å returnere enten verdien av den nærmeste prøven eller en interpolert, avstandsvektet verdi av k nærmeste naboer til den samplede plasseringen.

        // Working with sparse data
	public SparseExample()
	{
		// the interval in which to create random points
		FinalInterval interval = new FinalInterval( new long[] { 375, 200 } );
		// create an IterableRealInterval
		IterableRealInterval< FloatType > realInterval = createRandomPoints( interval, 250 );
		// using nearest neighbor search we will be able to return a value an any position in space
		NearestNeighborSearch< FloatType > search =
			new NearestNeighborSearchOnKDTree<>(
				new KDTree<>( realInterval ) );
		// make it into RealRandomAccessible using nearest neighbor search
		RealRandomAccessible< FloatType > realRandomAccessible =
			Views.interpolate( search, new NearestNeighborSearchInterpolatorFactory< FloatType >() );
		// convert it into a RandomAccessible which can be displayed
		RandomAccessible< FloatType > randomAccessible = Views.raster( realRandomAccessible );
		// set the initial interval as area to view
		RandomAccessibleInterval< FloatType > view = Views.interval( randomAccessible, interval );
		// display the view
		ImageJFunctions.show( view );
		// compute a gauss on it
		Img< FloatType > convolved = new ArrayImgFactory<>( new FloatType() ).create( interval );
		Gauss.inFloat( new double[] { 3, 3 }, view, interval, convolved,
			new Point( view.numDimensions() ), convolved.factory() );
		// display the view
		ImageJFunctions.show( convolved );
	}