1. Товары
  2.   Диаграмма
  3.   Python
  4.   pyCirclize
 
  

Бесплатная библиотека Python для круговых визуализаций

Открытая библиотека Python для создания круговой визуализации. Библиотека позволяет создавать диаграммы аккордов, круговые тепловые карты, круговые столбчатые графики, радиальные диаграммы и многое другое.

В постоянно развивающемся мире визуализации данных разработчики постоянно ищут инструменты, сочетающие гибкость, простоту использования и мощные возможности. Библиотека pyCirclize — один из таких открытых инструментов на Python, позволяющий разработчикам создавать впечатляющие круговые визуализации с минимальными усилиями. Библиотека предназначена для программного создания и управления круговыми визуализациями. Вдохновлённая пакетом R circlize, она позволяет разработчикам создавать потрясающие круговые графики для геномных, биологических и задач визуализации данных. Библиотека предлагает интуитивный API для отрисовки дорожек, тепловых карт, связей и многого другого, что делает её ценным инструментом для разработчиков программного обеспечения, желающих интегрировать круговые диаграммы в свои приложения.

Библиотека pyCirclize построена на основе Matplotlib, что делает её высоко настраиваемой и совместимой с другими инструментами визуализации Python. Ниже перечислены некоторые выдающиеся возможности, которые делают pyCirclize мощным инструментом для разработчиков: она визуализирует отношения между объектами с настраиваемыми связями и цветами, представляет матрицы или иерархические данные в радиальном расположении, отображает категориальные данные в круговом формате с аннотациями, создаёт карты хромосом, генные дорожки и синтениические графики, построенные на Matplotlib, позволяя разработчикам настраивать каждый аспект визуализации, бесшовно интегрироваться с другими библиотеками и фреймворками Python и т.д. Разработчики программного обеспечения могут комбинировать pyCirclize с интерактивными фреймворками, такими как Dash или Streamlit, для создания веб‑приложений, а также оптимизировать производительность, эффективно обрабатывая большие наборы данных перед визуализацией.

Начало работы с pyCirclize

Рекомендуемый способ установки библиотеки pyCirclize — использовать PyPI. Пожалуйста, используйте следующую команду для беспроблемной установки.

Установите библиотеку pyCirclize через PyPI

pip install pycirclize

Установите библиотеку Py2pUML с помощью conda-forge

Install conda-forge package

Создавайте диаграммы аккордов с помощью Python

Хордовые диаграммы идеальны для визуализации взаимосвязей между объектами. Открытая библиотека pyCirclize позволяет разработчикам программного обеспечения создавать хордовые диаграммы с настраиваемыми цветами, метками и стилями связей внутри Python‑приложений. Следующий пример демонстрирует, как создать хордовую диаграмму, показывающую взаимосвязи между объектами A, B, C и D с использованием команд Python.

Как создать диаграмму аккордов в приложениях Python?

from pycirclize import Circos
import matplotlib.pyplot as plt

# Define relationships
relationships = [
    ("A", "B", 5),
    ("A", "C", 3),
    ("B", "C", 2),
    ("C", "D", 7),
    ("D", "A", 4),
]

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=["A", "B", "C", "D"])

# Add chords
for source, target, value in relationships:
    circos.link((source, 0, 1), (target, 0, 1), color="skyblue", direction=1, ec="black", lw=1)

# Plot
circos.plot()
plt.show()

Поддержка круговых тепловых карт

Круговые тепловые карты — отличный способ представить данные в радиальном виде. Разработчики программного обеспечения могут использовать их для отображения матриц или иерархических данных в своих приложениях. Следующий пример кода генерирует круговую тепловую карту с использованием случайных данных. Вы можете расширить его, создав приложение, позволяющее пользователям загружать свои наборы данных и настраивать тепловую карту.

Как создать круговую тепловую карту с использованием библиотеки Python?

import numpy as np
from pycirclize import Circos

# Generate random data
np.random.seed(42)
data = np.random.rand(10, 10)

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=np.arange(10))

# Add heatmap
circos.heatmap(data, cmap="viridis")

# Plot
circos.plot()
plt.show()

Создание круговых столбчатых графиков

Круговые столбчатые графики идеально подходят для визуализации категориальных данных в круговом формате. Они высоко настраиваемы и могут включать аннотации. Открытая библиотека pyCirclize упрощает разработчикам программного обеспечения создание и управление круговыми столбчатыми графиками в Python‑приложениях. Следующий пример кода создает круговой столбчатый график, показывающий значения для различных категорий. Вы можете интегрировать его в приложение для исследования данных и составления отчетов.

Как создать круговую столбчатую диаграмму с использованием библиотеки Python?

import numpy as np
from pycirclize import Circos

# Generate random data
np.random.seed(42)
data = np.random.rand(10, 10)

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=np.arange(10))

# Add heatmap
circos.heatmap(data, cmap="viridis")

# Plot
circos.plot()
plt.show()

Визуализация геномных данных

Открытая библиотека pyCirclize особенно полезна для визуализации геномных данных в приложениях Python. Она предоставляет специализированные инструменты для визуализации геномных данных, такие как карты хромосом, генные дорожки и синтении графики. Ниже приведён полезный пример кода, позволяющий разработчикам создавать круговой график, представляющий хромосомы с их соответствующими размерами.

Как создать круговой график, представляющий хромосомы, с помощью Python?

from pycirclize import Circos

# Define chromosome sizes
genome = {
    "Chr1": 200,
    "Chr2": 150,
    "Chr3": 100,
}

# Create Circos instance
circos = Circos(sectors=genome)

# Add chromosome tracks
for sector in circos.sectors:
    sector.text(f"{sector.name}", size=15)
    sector.xticks_by_interval(50, label_size=10)

# Plot
circos.plot()
plt.show()